#k codon indel-tally syn-tally nonsyn-tally
#k The number of codons is: 191
#k The average behavior for 153 comparisons:
#k Cumulative Per Codon
#k __________________ __________________
#k codon indel syn nonsyn indel syn nonsyn aa avg syn 10 avg nonsyn 10 entropy Hb
1 0 0 0 0 0 0 M 0.056 0.092 0 0
2 0 0 0 0 0 0 S 0.067 0.092 0 0
3 0 0.06 0.17 0 0.06 0.17 T 0.067 0.092 0.215 -0.215
4 0 0.06 0.39 0 0 0.22 L 0.061 0.075 0.215 -0.215
5 0 0.17 0.39 0 0.11 0 P 0.061 0.053 0 0
6 0 0.17 0.39 0 0 0 K 0.071 0.064 0 0
7 0 0.56 0.39 0 0.39 0 P 0.071 0.116 0 0
8 0 0.56 0.5 0 0 0.11 Q 0.074 0.116 0.215 -0.215
9 0 0.56 0.5 0 0 0 R 0.113 0.105 0 0
10 0 0.56 0.92 0 0 0.42 I 0.113 0.105 0.684 -0.684
11 0 0.67 0.92 0 0.11 0 T 0.113 0.074 0 0
12 0 0.67 0.92 0 0 0 K 0.102 0.103 0 0
13 0 0.67 0.92 0 0 0 R 0.159 0.124 0 0
14 0 0.67 0.92 0 0 0 N 0.159 0.124 0 0
15 0 0.88 1.03 0 0.21 0.11 T 0.159 0.124 0.215 -0.215
16 0 0.88 1.55 0 0 0.52 N 0.159 0.113 0.761 -0.761
17 0 1.3 1.55 0 0.42 0 R 0.188 0.072 0 0
18 0 1.7 1.55 0 0.39 0 R 0.157 0.072 0 0
19 0 1.7 1.55 0 0 0 P 0.179 0.072 0 0
20 0 1.7 1.66 0 0 0.11 Q 0.179 0.094 0.215 -0.215
21 0 1.7 1.95 0 0 0.29 D 0.179 0.083 0.451 -0.451
22 0 2.26 2.16 0 0.57 0.21 V 0.179 0.076 0.349 -0.349
23 0 2.26 2.16 0 0 0 K 0.133 0.066 0 0
24 0 2.26 2.16 0 0 0 F 0.144 0.077 0 0
25 0 2.47 2.16 0 0.21 0 P 0.173 0.077 0 0
26 0 2.77 2.27 0 0.29 0.11 G 0.173 0.077 0.215 -0.215
27 0 2.88 2.27 0 0.11 0 G 0.166 0.066 0 0
28 0 3.49 2.27 0 0.61 0 G 0.218 0.066 0 0
29 0 3.49 2.49 0 0 0.22 Q 0.188 0.066 0.215 -0.215
30 0 3.49 2.49 0 0 0 I 0.199 0.044 0 0
31 0 3.49 2.72 0 0 0.22 V 0.199 0.044 0.215 -0.215
32 0 3.6 2.83 0 0.11 0.11 G 0.21 0.022 0.215 -0.215
33 0 3.71 2.94 0 0.11 0.11 G 0.23 0.011 0.215 -0.215
34 0 4 2.94 0 0.29 0 V 0.274 0.06 0 0
35 0 4.21 2.94 0 0.21 0 Y 0.245 0.06 0 0
36 0 4.43 2.94 0 0.22 0 V 0.224 0.06 0 0
37 0 5.06 2.94 0 0.63 0 L 0.202 0.06 0 0
38 0 5.37 2.94 0 0.31 0 P 0.168 0.081 0 0
39 0 5.48 2.94 0 0.11 0 R 0.174 0.092 0 0
40 0 5.48 2.94 0 0 0 R 0.191 0.174 0 0
41 0 5.59 2.94 0 0.11 0 G 0.212 0.174 0 0
42 0 5.9 2.94 0 0.31 0 P 0.243 0.174 0 0
43 0 6.45 3.54 0 0.55 0.6 K 0.212 0.174 0.761 -0.761
44 0 6.45 3.54 0 0 0 L 0.199 0.114 0 0
45 0 6.45 3.54 0 0 0 G 0.241 0.114 0 0
46 0 6.45 3.54 0 0 0 V 0.261 0.126 0 0
47 0 6.74 3.75 0 0.29 0.21 R 0.303 0.126 0.349 -0.349
48 0 7.11 3.86 0 0.37 0.11 A 0.316 0.105 0.215 -0.215
49 0 7.39 4.68 0 0.28 0.82 V 0.308 0.094 0.73 -0.73
50 0 7.6 4.68 0 0.21 0 R 0.302 0.012 0 0
51 0 8.02 4.68 0 0.42 0 K 0.3 0.052 0 0
52 0 8.02 4.68 0 0 0 T 0.34 0.052 0 0
53 0 8.45 4.68 0 0.42 0 S 0.393 0.052 0 0
54 0 8.87 4.68 0 0.42 0 E 0.38 0.063 0 0
55 0 9.07 4.8 0 0.2 0.12 R 0.359 0.063 0.215 -0.215
56 0 9.5 4.8 0 0.42 0 S 0.35 0.062 0 0
57 0 9.92 4.8 0 0.42 0 Q 0.308 0.062 0 0
58 0 10.22 4.8 0 0.29 0 P 0.266 0.083 0 0
59 0 10.43 4.8 0 0.22 0 R 0.258 0.083 0 0
60 0 10.62 5.2 0 0.19 0.4 S 0.278 0.094 0.557 -0.557
61 0 11.44 5.2 0 0.82 0 R 0.296 0.085 0 0
62 0 11.97 5.2 0 0.53 0 R 0.214 0.137 0 0
63 0 12.27 5.31 0 0.29 0.11 Q 0.201 0.169 0.215 -0.215
64 0 12.47 5.31 0 0.21 0 P 0.193 0.158 0 0
65 0 12.59 5.42 0 0.11 0.11 I 0.194 0.158 0.215 -0.215
66 0 12.59 5.42 0 0 0 P 0.183 0.158 0 0
67 0 12.59 5.63 0 0 0.21 R 0.183 0.158 0.349 -0.349
68 0 12.79 5.63 0 0.21 0 A 0.222 0.137 0 0
69 0 13.22 5.74 0 0.42 0.11 R 0.201 0.137 0.215 -0.215
70 0 13.59 6.05 0 0.37 0.31 R 0.196 0.126 0.557 -0.557
71 0 13.59 6.56 0 0 0.52 T 0.159 0.095 0.884 -0.884
72 0 13.98 6.88 0 0.4 0.32 E 0.159 0.043 0.634 -0.634
73 0 14.19 6.88 0 0.21 0 G 0.13 0.011 0 0
74 0 14.41 6.88 0 0.22 0 R 0.109 0.011 0 0
75 0 14.41 7 0 0 0.11 S 0.087 0.011 0.215 -0.215
76 0 14.41 7 0 0 0 W 0.118 0 0 0
77 0 14.79 7 0 0.39 0 A 0.139 0 0 0
78 0 14.79 7 0 0 0 Q 0.137 0 0 0
79 0 15.16 7 0 0.37 0 P 0.184 0 0 0
80 0 15.16 7 0 0 0 G 0.147 0 0 0
81 0 15.16 7 0 0 0 Y 0.147 0 0 0
82 0 15.27 7 0 0.11 0 P 0.168 0 0 0
83 0 15.27 7 0 0 0 W 0.178 0 0 0
84 0 15.27 7 0 0 0 P 0.178 0 0 0
85 0 15.58 7 0 0.31 0 L 0.178 0 0 0
86 0 15.79 7 0 0.21 0 Y 0.189 0 0 0
87 0 16.15 7 0 0.37 0 G 0.168 0 0 0
88 0 16.62 7 0 0.47 0 N 0.131 0.011 0 0
89 0 16.62 7 0 0 0 E 0.095 0.011 0 0
90 0 16.62 7 0 0 0 G 0.095 0.022 0 0
91 0 16.83 7 0 0.21 0 C 0.16 0.022 0 0
92 0 17.04 7 0 0.21 0 G 0.139 0.022 0 0
93 0 17.04 7 0 0 0 W 0.139 0.022 0 0
94 0 17.04 7 0 0 0 A 0.186 0.022 0 0
95 0 17.47 7 0 0.42 0 G 0.232 0.022 0 0
96 0 17.47 7 0 0 0 W 0.211 0.022 0 0
97 0 17.47 7.11 0 0 0.11 L 0.261 0.109 0.215 -0.215
98 0 17.58 7.11 0 0.11 0 L 0.261 0.098 0 0
99 0 17.58 7.22 0 0 0.11 S 0.25 0.109 0.215 -0.215
100 0 18.23 7.22 0 0.65 0 P 0.26 0.12 0 0
101 0 18.23 7.22 0 0 0 R 0.237 0.12 0 0
102 0 18.44 7.22 0 0.21 0 G 0.237 0.12 0 0
103 0 18.91 7.22 0 0.47 0 S 0.216 0.12 0 0
104 0 19.37 7.22 0 0.46 0 R 0.169 0.12 0 0
105 0 19.58 7.22 0 0.21 0 P 0.191 0.12 0 0
106 0 20.08 8.09 0 0.5 0.87 S 0.249 0.12 0.634 -0.634
107 0 20.08 8.09 0 0 0 W 0.21 0.033 0 0
108 0 20.08 8.2 0 0 0.11 G 0.21 0.033 0.215 -0.215
109 0 20.18 8.41 0 0.1 0.22 P 0.247 0.022 0.349 -0.349
110 0 20.61 8.41 0 0.42 0 N 0.237 0 0 0
111 0 20.61 8.41 0 0 0 D 0.206 0 0 0
112 0 20.61 8.41 0 0 0 P 0.256 0 0 0
113 0 20.61 8.41 0 0 0 R 0.256 0.011 0 0
114 0 21.29 8.41 0 0.68 0 R 0.256 0.011 0 0
115 0 22.08 8.41 0 0.79 0 R 0.199 0.011 0 0
116 0 22.19 8.41 0 0.11 0 S 0.12 0.011 0 0
117 0 22.19 8.41 0 0 0 R 0.171 0.011 0 0
118 0 22.55 8.41 0 0.37 0 N 0.182 0.011 0 0
119 0 22.55 8.41 0 0 0 L 0.156 0.011 0 0
120 0 22.66 8.41 0 0.11 0 G 0.178 0.011 0 0
121 0 23.17 8.41 0 0.5 0 K 0.178 0.011 0 0
122 0 23.17 8.53 0 0 0.11 V 0.139 0.011 0.215 -0.215
123 0 23.17 8.53 0 0 0 I 0.16 0 0 0
124 0 23.28 8.53 0 0.11 0 D 0.16 0 0 0
125 0 23.28 8.53 0 0 0 T 0.149 0 0 0
126 0 23.9 8.53 0 0.62 0 L 0.149 0 0 0
127 0 24.01 8.53 0 0.11 0 T 0.108 0 0 0
128 0 24.12 8.53 0 0.11 0 C 0.134 0 0 0
129 0 24.34 8.53 0 0.22 0 G 0.134 0 0 0
130 0 24.45 8.53 0 0.11 0 F 0.112 0 0 0
131 0 24.56 8.53 0 0.11 0 A 0.131 0.011 0 0
132 0 24.77 8.53 0 0.21 0 D 0.12 0.011 0 0
133 0 24.77 8.53 0 0 0 L 0.146 0.011 0 0
134 0 24.77 8.53 0 0 0 M 0.193 0.011 0 0
135 0 24.77 8.53 0 0 0 G 0.241 0.022 0 0
136 0 24.98 8.53 0 0.21 0 Y 0.288 0.022 0 0
137 0 25.34 8.53 0 0.37 0 I 0.267 0.022 0 0
138 0 25.46 8.53 0 0.11 0 P 0.241 0.033 0 0
139 0 25.46 8.53 0 0 0 L 0.241 0.033 0 0
140 0 25.76 8.64 0 0.3 0.11 V 0.27 0.033 0.215 -0.215
141 0 25.76 8.64 0 0 0 G 0.261 0.022 0 0
142 0 26.23 8.64 0 0.47 0 A 0.292 0.033 0 0
143 0 26.7 8.64 0 0.47 0 P 0.298 0.033 0 0
144 0 27.18 8.75 0 0.48 0.11 V 0.262 0.033 0.215 -0.215
145 0 27.65 8.75 0 0.47 0 G 0.253 0.022 0 0
146 0 27.65 8.75 0 0 0 G 0.241 0.038 0 0
147 0 27.76 8.86 0 0.11 0.11 V 0.299 0.038 0.215 -0.215
148 0 27.87 8.86 0 0.11 0 A 0.334 0.027 0 0
149 0 28.16 8.86 0 0.29 0 R 0.334 0.038 0 0
150 0 28.37 8.86 0 0.21 0 A 0.355 0.038 0 0
151 0 28.68 8.97 0 0.31 0.11 L 0.334 0.038 0.215 -0.215
152 0 29.21 8.97 0 0.53 0 A 0.34 0.027 0 0
153 0 29.32 8.97 0 0.11 0 H 0.324 0.058 0 0
154 0 29.71 8.97 0 0.39 0 G 0.334 0.058 0 0
155 0 30.06 9.13 0 0.35 0.16 I 0.332 0.087 0.215 -0.215
156 0 30.63 9.13 0 0.58 0 R 0.308 0.071 0 0
157 0 31.1 9.13 0 0.46 0 A 0.25 0.071 0 0
158 0 31.21 9.24 0 0.11 0.11 L 0.204 0.071 0.215 -0.215
159 0 31.71 9.24 0 0.5 0 E 0.235 0.06 0 0
160 0 31.71 9.24 0 0 0 D 0.238 0.089 0 0
161 0 32.08 9.24 0 0.37 0 G 0.275 0.089 0 0
162 0 32.45 9.55 0 0.37 0.31 I 0.238 0.089 0.349 -0.349
163 0 32.66 9.55 0 0.21 0 N 0.201 0.058 0 0
164 0 33.03 9.85 0 0.37 0.29 F 0.217 0.058 0.451 -0.451
165 0 33.14 9.85 0 0.11 0 A 0.217 0.029 0 0
166 0 33.14 9.85 0 0 0 T 0.206 0.029 0 0
167 0 33.14 9.85 0 0 0 G 0.206 0.029 0 0
168 0 33.56 9.85 0 0.42 0 N 0.217 0.029 0 0
169 0 34.09 10.14 0 0.53 0.29 L 0.212 0.029 0 0
170 0 34.46 10.14 0 0.37 0 P 0.222 0.018 0 0
171 0 34.46 10.14 0 0 0 G 0.206 0.018 0 0
172 0 34.46 10.14 0 0 0 C 0.258 0.036 0 0
173 0 34.82 10.14 0 0.37 0 S 0.269 0.073 0 0
174 0 35.19 10.14 0 0.37 0 F 0.285 0.073 0 0
175 0 35.19 10.14 0 0 0 S 0.248 0.073 0 0
176 0 35.19 10.14 0 0 0 I 0.311 0.073 0 0
177 0 35.3 10.14 0 0.11 0 F 0.363 0.123 0 0
178 0 35.67 10.14 0 0.37 0 L 0.386 0.221 0 0
179 0 36.29 10.33 0 0.63 0.18 L 0.391 0.221 0 0
180 0 36.5 10.33 0 0.21 0 A 0.355 0.213 0 0
181 0 37.02 10.51 0 0.52 0.18 L 0.381 0.24 0.215 -0.215
182 0 37.13 10.88 0 0.11 0.37 L 0.354 0.273 0.53 -0.53
183 0 37.66 10.88 0 0.53 0 S 0.381111111 0.262222222 0 0
184 0 37.66 10.88 0 0 0 C 0.3625 0.295 0 0
185 0 38.29 10.88 0 0.63 0 L 0.414285714 0.337142857 0 0
186 0 38.82 11.38 0 0.52 0.5 L 0.378333333 0.393333333 0.778 -0.778
187 0.11 39.16 12.36 0.11 0.34 0.98 T 0.35 0.372 1.08 -1.08
188 0.22 39.58 12.36 0.11 0.42 0 P 0.3525 0.22 0.215 -0.215
189 0.33 39.85 12.46 0.11 0.27 0.1 A 0.33 0.293333333 0.426 -0.426
190 0.44 40.32 12.74 0.11 0.47 0.27 A 0.36 0.39 0.655 -0.655
191 0.56 40.57 13.25 0.11 0.25 0.51 G 0.25 0.51 0.73 -0.73
Questions or comments? Contact us at
hfv-info@lanl.gov