hfv top banner
HFV Ebola sequence database
 

#k	codon	indel-tally	syn-tally	nonsyn-tally								
#k	The	number	of	codons	is:	54						
#k	The	average	behavior	for	7021	comparisons:						
#k	Cumulative	Per	Codon									
#k	__________________	__________________										
#k	codon	indel	syn	nonsyn	indel	syn	nonsyn	aa	avg syn 10	avg nonsyn 10	entropy	Hb
	1	0	0.13	0.02	0	0.13	0.02	S	0.317	0.009	0.049	-0.049
	2	0	0.4	0.02	0	0.28	0	T	0.338	0.007	0	0
	3	0	0.4	0.02	0	0	0	W	0.335	0.01	0	0
	4	0.02	0.49	0.02	0.02	0.08	0	V	0.37	0.012	0.049	-0.049
	5	0.02	1.16	0.03	0	0.67	0.01	L	0.37	0.014	0	0
	6	0.02	1.62	0.04	0	0.47	0.02	V	0.346	0.013	0.049	-0.049
	7	0.02	1.75	0.06	0	0.13	0.02	G	0.348	0.011	0.049	-0.049
	8	0.02	2.36	0.06	0	0.61	0	G	0.345	0.009	0	0
	9	0.02	2.57	0.06	0	0.21	0	V	0.336	0.009	0	0
	10	0.02	3.16	0.08	0	0.59	0.02	L	0.337	0.028	0.049	-0.049
	11	0.02	3.49	0.08	0	0.34	0	A	0.317	0.026	0	0
	12	0.02	3.75	0.11	0	0.25	0.03	A	0.29	0.026	0.049	-0.049
	13	0.02	4.09	0.13	0	0.35	0.02	L	0.291	0.041	0.049	-0.049
	14	0.02	4.17	0.14	0	0.08	0.02	A	0.263	0.039	0.049	-0.049
	15	0.02	4.61	0.14	0	0.43	0	A	0.269	0.042	0	0
	16	0.02	5.09	0.14	0	0.49	0	Y	0.263	0.042	0	0
	17	0.02	5.19	0.14	0	0.1	0	C	0.226	0.044	0	0
	18	0.02	5.71	0.15	0	0.52	0	L	0.252	0.044	0	0
	19	0.02	5.92	0.33	0	0.22	0.19	S	0.216	0.046	0.384	-0.384
	20	0.02	6.31	0.33	0	0.39	0	T	0.217	0.041	0	0
	21	0.02	6.38	0.33	0	0.07	0	G	0.197	0.063	0	0
	22	0.02	6.63	0.52	0	0.26	0.18	S	0.227	0.064	0.327	-0.327
	23	0.02	6.7	0.52	0	0.07	0	V	0.228	0.058	0	0
	24	0.02	6.84	0.57	0	0.14	0.05	V	0.249	0.061	0.049	-0.049
	25	0.02	7.21	0.57	0	0.37	0	I	0.246	0.109	0	0
	26	0.02	7.33	0.59	0	0.12	0.02	V	0.228	0.112	0.049	-0.049
	27	0.02	7.69	0.59	0	0.36	0	G	0.271	0.115	0	0
	28	0.02	7.85	0.61	0	0.16	0.02	R	0.286	0.173	0	0
	29	0.02	8.08	0.75	0	0.23	0.14	I	0.302	0.21	0.312	-0.312
	30	0.02	8.27	0.96	0	0.19	0.22	I	0.312	0.196	0.375	-0.375
	31	0.02	8.63	0.98	0	0.37	0.01	L	0.316	0.176	0	0
	32	0.02	8.9	1.1	0	0.27	0.12	S	0.295	0.177	0.097	-0.097
	33	0.02	9.18	1.12	0	0.28	0.03	G	0.291	0.168	0.049	-0.049
	34	0.02	9.29	1.65	0	0.11	0.53	K	0.311	0.183	0.049	-0.049
	35	0.02	9.48	1.69	0	0.19	0.03	P	0.325	0.133	0.049	-0.049
	36	0.02	10.03	1.74	0	0.55	0.05	A	0.322	0.132	0.118	-0.118
	37	0.02	10.54	2.32	0	0.51	0.58	V	0.294	0.179	0.82	-0.82
	38	0.02	10.85	2.7	0	0.32	0.39	I	0.25	0.137	0.592	-0.592
	39	0.02	11.19	2.7	0	0.33	0	P	0.231	0.098	0	0
	40	0.02	11.42	2.72	0	0.23	0.02	D	0.212	0.098	0	0
	41	0.02	11.58	2.74	0	0.16	0.02	R	0.239	0.096	0	0
	42	0.02	11.81	2.77	0	0.23	0.03	E	0.223	0.094	0.097	-0.097
	43	0.02	12.29	2.95	0	0.48	0.18	V	0.233	0.091	0.392	-0.392
	44	0.02	12.54	2.98	0	0.25	0.03	L	0.19	0.076	0	0
	45	0.02	12.7	3	0	0.16	0.02	Y	0.197	0.075	0	0
	46	0.02	12.97	3.52	0	0.27	0.52	R	0.201111111	0.081111111	0.729	-0.729
	47	0.02	13.04	3.68	0	0.07	0.16	E	0.1925	0.02625	0.36	-0.36
	48	0.02	13.17	3.68	0	0.13	0	F	0.21	0.007142857	0	0
	49	0.02	13.31	3.68	0	0.14	0	D	0.223333333	0.008333333	0	0
	50	0.02	13.81	3.68	0	0.5	0	E	0.24	0.01	0	0
	51	0.02	13.81	3.68	0	0	0	M	0.175	0.0125	0	0
	52	0.02	14.15	3.68	0	0.33	0	E	0.233333333	0.016666667	0	0
	53	0.02	14.2	3.71	0	0.05	0.03	E	0.185	0.025	0.097	-0.097
	54	0.02	14.52	3.73	0	0.32	0.02	C	0.32	0.02	0.049	-0.049



Questions or comments? Contact us at hfv-info@lanl.gov